Hazy Ideas

日々の勉強の気づきを書き出しています

2020-12-01から1ヶ月間の記事一覧

ブログ移行しました

旧ブログから移行しました。タイトルは同じです。

QIIME2でNCBIデータベースを扱う

Anaconda環境下でインストールしたCUI遺伝子解析ソフトQIIME2で、NCBIから落としたntデータベースを扱いたいので、メモ。 どうやらBroccとRESCRIPtという2種類の方法があるようなので、qiime2-2020.8の上でとりあえずインストールする。 Brocc pip install …

ubuntu 備忘録7

機械学習に必要な環境準備、アプリのインストール 環境:ubuntu20.04, Anaconda 1.Nvidia driverインストール #PPAのリポジトリを追加 sudo add-apt-repository ppa:graphics-drivers/ppa アップデート sudo apt update インストールするバージョンチェッ…

ubuntu 備忘録6

Anaconda環境でQGISをインストールして動かす。 Using QGIS from Conda – GIS Unchained 仮想環境を作成して環境を立ち上げる conda create --name qgis_env python=3 conda activate qgis_env QGISのlong time release版をインストールして起動 conda insta…

博士課程x年目で思うところ

年が変わる前に、一回、最近思うことを改めて文章にしてみようと思う。記録と頭の整理用。 おさらいとして、私は社会人を数年経験して、博士課程に進学した者である。国際協力系の分野にかつては憧れつつも、自分ができることは理系の基礎研究系だったので、…

ubuntu 備忘録5

sudo apt でインストールしたパッケージのアンインストール sudo apt remove --purge パッケージ名 関係するファイル系も全部消したいなら sudo apt autoremove パッケージ名

UbuntuにGRASSをインストールする

バージョン確認 cat /etc/os-release conda info grass --help 環境 Ubuntu 20.04.1 Focal Fossa Anaconda version 4.9.2 Python version 3.8.5 GRASS GIS 7.8.2 GRASSを以下のコマンドでインストール(最新版が入るはず) sudo apt-get install grass grass…